С 2012 года в Балтийском федеральном университете им. И. Канта осуществляется реорганизация основных учебных подразделений. Укрупняются кафедры, из прежних факультетов и колледжей формируются институты, более крупные, чем прежние факультеты. Приказом ректора университета от 15 февраля 2013 г. в Институт природопользования, территориального развития и градостроительства объединены факультет Географии и геоэкологии (с программами высшего профессионального, послевузовского и дополнительного образования) и Градостроительный колледж (с программами среднего профессионального и дополнительного образования). В составе факультета географии и геоэкологии функционировали 4 кафедры: физической географии, социально-экономической географии и геополитики, географии океана, геоэкологии. В процессе реорганизации кафедра географии океана стала базовой кафедрой университета в Атлантическом отделении Институт океанологии им. П.П. Ширшова РАН. Из остальных кафедр часть преподавателей перешла на вновь образованную кафедру градостроительства, землепользования и дизайна, а остальные составили кафедру географии, природопользования и пространственного развития. Среднее профессиональное образование (СПО) представлено в Институте шестью программами: Строительство и эксплуатация зданий и сооружений; Архитектура; Информационные системы обеспечения градостроительной деятельности (раньше эта программа называлась «Градостроительный кадастр»); Монтаж и эксплуатация оборудования и систем газоснабжения; Строительство и эксплуатация дорог и аэродромов; Водоснабжение и водоотведение. Уже сейчас налажены вертикальные связи между программами СПО и ВПО. Так, программа СПО «Информационные системы обеспечения градостроительной деятельности» (которая реализовывалась в колледже) получает дальнейшее развитие в программе бакалавриата ВПО «Землеустройство и кадастры» (профиль «Земельный кадастр»), по которому получена лицензия факультетом географии и геоэкологии. А получив диплом техника по программе СПО «Архитектура» можно продолжить образование по близкой программе бакалавриата «Дизайн». Пока по этой программе подготовка ведется по профилю «Графический дизайн», но уже со следующего года планируется открытие профиля «Ландшафтный дизайн». Дальнейшее обучение можно продолжить в магистратуре по соответствующим программам. Объединяет географические и градостроительные специальности также магистратура по программе «Стратегическое и территориальное планирование». Еще более тесные связи будут установлены с открытием бакалавриата и магистратуры по направлению «Градостроительство», бакалавриата по профилю «Городской кадастр» и магистратуры по направлению «Землеустройство и кадастры». Социально-экономическая география через территориальное планирование стала связующим звеном двух направлений деятельности нового института. Еще более важную связующую роль будет играть «Градостроительное проектирование» как профиль бакалавриата и программа магистратуры. Отметим также, что сам институт, кафедра Градостроительства, землепользования и дизайна, и кафедра Географии, природопользования и пространственного развития возглавляются экономико-географами. На кафедре Географии, природопользования и пространственного развития за экономико-географами закреплена магистратура «Страноведение Балтийского региона», они обеспечивают также ряд общих курсов на бакалавриате. Кафедра градостроительства, землепользования и дизайна отвечает за программу бакалавриата «Региональная политика и территориальное управление» и магистратуры «Стратегическое и территориальное планирование». В дальнейшем, по мере лицензирования новых направлений подготовки, экономико-географы будут играть большую роль в преподавании дисциплин по направлению бакалавриата «Градостроительство» (профиль «Градостроительное проектирование») и соответствующей магистратуры. Набор в магистратуру по направлению «География», профиль «Физическая география и ландшафтоведение был осуществлен в 2011 году. Две программы магистратуры по направлению «География», по одной – по направлениям «геоэкология» и «дизайн» были разработаны в 2013 году в соответствии с Программой развития федерального университета. К их разработке были привлечены не только профессора и преподаватели БФУ им. И.Канта, но и ведущие ученые Московского и Санкт-Петербургского университетов (профессора В.Л.Бабурин, А.И.Чистобаев, Н.М.Межевич, декан факультета географии и геоэкологии СПбГУ Н.В.Каледин), специалисты-практики, работающие в проектных организациях (к.г.н. В.И.Пустовгаров, к.г.н. С.В.Скатерщиков). В течение ближайших двух лет предполагается разработать еще 4 новые программы магистратуры по трем направлениям подготовки – гидрометеорология (программа «морская океанология»), землеустройство и кадастры (программы «земельный кадастр» и «городской кадастр»), градостроительство (программа «градостроительное проектирование). Для подготовки кадров по новым направлениям Институт располагает большой аспирантурой (около 100 аспирантов), а также докторантурой (по геоэкологии и географии океана). Специальности аспирантуры: «Физическая география и биогеография, география почв и геохимия ландшафтов», «Экономическая, социальная, политическая и рекреационная география», «Океанология», «Геоэкология». Готовится к лицензированию специальность «Землеустройство, кадастр и мониторинг земель». Действует докторский диссертационный совет по специальностям «Геоэкология»; «Океанология»; «Экономическая, социальная, политическая и рекреационная география». Благодаря участию университета во многих международных программах (Темпус, Эразмус Мундус, Балтийский университет, EU4U и др.), в проектах фонда DBU и Программы приграничного сотрудничества Польша – Литва – Россия, студенты и аспиранты института имеют возможность принимать участие в круглых столах, обучающих семинарах, проходить стажировки в зарубежных вузах. В повышении квалификации профессорско-преподавательского состава большое значение имеют научные проекты, в которых участвуют сотрудники Института. В университете имеются хорошие возможности для публикации результатов исследований – выпускаются ВАКовские журналы «Вестник БФУ им. И.Канта (серия естественные науки)» и, совместно с Санкт-Петербургским университетом (но на базе БФУ им. И.Канта) – «Балтийский регион», обладающий неплохим импакт-фактором (поставлена цель – добиться его включения в Scopus). Разработка «Территориальной комплексной схемы градостроительного планирования развития территории Калининградской области и ее частей (которая в 2004 г. была пионерной для России и получила первую премию Госстроя РФ, а также серебряную медаль на Международной выставке в Лондоне), Генерального плана Приморской функциональной рекреационной зоны (2002 г.) показал преимущества совместной работы специалистов – архитекторов, градостроителей и экономико-географов в подготовке такого рода документов. Поэтому представляется весьма перспективным для научных исследований пространственной организации территории, предпроектных разработок и обоснования документов территориального планирования соединение ученых этих специальностей в одном институте. В результате будет происходить и взаимообогащение учебных курсов и программ, реализуемых Институтом природопользования, территориального развития и градостроительства.